Yves Gibon

Directeur de recherche INRAE, Yves Gibon a travaillé durant une dizaine d’années en Allemagne, notamment au Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, avant d’intégrer en 2008 le laboratoire Biologie du fruit et pathologie (BFP - Inrae et université de Bordeaux) dont il est aujourd’hui directeur. Il y pilote l’équipe META (Métabolisme) dont les projets de recherches, très fortement multidisciplinaires, touchent à la biologie prédictive et la biologie des systèmes. Le métabolisme des plantes est au centre de ses travaux : il étudie ses mécanismes et les modélise en vue d’améliorer la sélection des variétés et les pratiques culturales. Auteur de nombreuses publications, il faisait partie en 2015 de la liste Thomson Reuters des chercheurs les plus cités au monde.

Yves Gibon est également impliqué dans la plateforme de métabolomique de l’université de Bordeaux, l’une des quatre plateformes leaders en France.

Les recherches d’Yves Gibon dessinent une stratégie en plusieurs points :

• Tisser des liens entre le phénotype des plantes et leur métabolome (ensemble des métabolites) afin de rendre la métabolomique accessible à la sélection à côté de la génomique. L’équipe vise la réalisation d’un démonstrateur pré-industriel.
• Utiliser cette capacité à faire des prédictions sur les traits d’une plante grâce au métabolome en agroécologie. L’objectif est de pouvoir proposer des assemblages performants d’espèces et, in fine, des agrosystèmes plus résilients.
• Dans le cadre d’un nouveau Grand programme de recherche, Bordeaux Plant Sciences, étudier et optimiser les trade-offs (les compromis) en agroécologie : gagner en résilience (défense face à la sécheresse, aux maladies etc.) sans trop impacter la croissance de la plante et ainsi sécuriser le rendement plutôt que chercher l’optimum de production.

Références

• Mutant tomato helps to crack the secrets of fruiting (ScienceDaily, 10/09/2020)
• Six chercheurs bordelais cités par leurs pairs (Valérie Deymes, Sud Ouest, 16/01/2016)

• Yoshihito Shinozaki, Bertrand P. Beauvoit, Masaru Takahara, and al. Fruit setting rewires central metabolism via gibberellin cascades, Proceedings of the National Academy of Sciences, 117 (38) 23970-23981, 2020
• Léa Roch, Sylvain Prigent, Holger Klose, and al. Biomass composition explains fruit relative growth rate and discriminates climacteric from non-climacteric species, Journal of Experimental Botany, Volume 71, Issue 19, 5823–5836, 2020
• Colombié Sophie, Beauvoit Bertrand, Nazaret Christine, and al. Respiration climacteric in tomato fruits elucidated by constraint-based modelling, New Phytol, 213: 1726-1739, 2017
• Olivier Fernandez, Emilie Millet, Renaud Rincent, et al. Plant metabolomics and breeding, Plant Metabolomics in full swing, 98, pp.207-235, Advances in Botanical Research, 2021